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741 人阅读发布时间:2025-02-12 17:02

在生命科学这一广袤而深邃的领域里,蛋白质组学正日益崛起为一颗璀璨的新星,为揭示疾病机制、推动药物研发进程及强化公共卫生体系建设开辟了新的广阔天地。近几年来,新技术革新如同破竹之势,迅猛发展,令人瞩目。特此介绍一项近期蛋白质研究领域内最为炙手可热的技术——高深度血液靶向蛋白质组SomaScan 7K/11K。这项技术不仅荣获了美国食品药品监督管理局(FDA)的权威认可,更频繁地在《美国医学会杂志》(JAMA)主刊、《自然》(Nature)、《科学》(Science)及《细胞》(Cell)等国际顶刊上崭露头角,彰显了其卓越的研究价值与广泛的影响力。值得一提的是,SomaScan技术已在诸如英国生物银行(UK Biobank)、欧洲前瞻性调查研究(EPIC study)以及中国慢性病前瞻性研究项目(The China Kadoorie Biobank)等多个大型队列蛋白质组学研究中得到了广泛而深入的应用。在衰老、肿瘤、遗传、神经、代谢疾病等方向均有井喷式的顶刊文章成果产出。发表相关文章已达1219篇,其中Nature-9篇,Cell-7篇,Science-6篇,JAMA-3篇,2024年发表文章共计273篇,且频繁被CNS应用。接下来,请跟随小编一起看一看近两年的顶刊文章利用高深度血液靶向蛋白质组SomaScan 7K/11K技术做了哪些研究吧!
JAMA
中文标题:大规模蛋白质组学用于预测心血管疾病影响因子:123
发表年份:2023年
合作单位:deCODE genetics、冰岛大学
主要结论:大规模蛋白质组学主要是对冰岛 13540 名个体 (40-75岁) 的原发性事件进行回顾性研究,还分析了一项来自随机、双盲降脂临床试验 (2013-2016) 的继发事件人群,使用 SomaScan 平台在队列中测量 4963 种蛋白质水平,使用 Cox 生存模型和区分和重新分类措施评估性能,在主要事件人群测试集(4018人)中,蛋白质风险评分的风险比(HR)为1.93/SD。当添加到临床风险因素模型时,蛋白质风险评分和多基因风险评分的增加使C指数显著变化。单独将蛋白质风险评分添加到临床风险因素模型中也导致C 指数显著升高。在次要事件人群中的白人个体中 (6307 名参与者),蛋白质风险评分的HR 为 1.62/SD,当添加到临床风险因素模型时,C指数显着增加。蛋白质风险评分与继发事件人群中非洲和亚洲血统个体的主要不良心血管事件显著相关。
Nature
中文标题:吸烟影响适应性免疫并产生持续作用
影响因子:50.5
发表年份:2024年
合作单位:法国巴黎西岱大学巴斯德研究所
主要结论:研究通过对Milieu Intérieur 队列中的 1000 名(20 - 69 岁)健康个体样本的研究,确定吸烟、巨细胞病毒潜伏感染和体重指数是细胞因子反应变异性的主要因素,吸烟对固有和适应性免疫反应均有影响,其对适应性免疫反应的持续影响与特定细胞亚群和 DNA 甲基化有关。揭示了吸烟对免疫反应的短期和长期影响,为理解吸烟对健康的影响及环境因素对免疫反应的作用提供了新视角。未来可在其他人群中验证,并进一步探究吸烟对适应性免疫反应持续影响的转录调控网络。
Cell
中文标题:CSF 蛋白质组学确定常染色体显性遗传阿尔茨海默病的早期变化
影响因子:45.5
发表年份:2024年
合作单位:美国华盛顿大学
主要结论:在这项常染色体显性遗传阿尔茨海默病 (ADAD) 的高通量蛋白质组学研究中,计划确定脑脊液 (CSF) 中的早期生物标志物,用于疾病监测和治疗策略。研究人员检查了 286 个突变携带者 (MCs) 和 177 个非携带者 (NCs) 中的 CSF 蛋白。开发的多层回归模型区分了这些组之间具有不同伪轨迹的蛋白质。使用独立的数据集验证了我们的发现,并采用机器学习来开发和验证预测模型。最后研究确定了 137 种在 MC 和 NC 之间具有不同轨迹的蛋白质,其中 8 种在传统 AD 生物标志物之前发生了变化。这些蛋白质分为三个阶段:早期(应激反应、谷氨酸代谢、神经元线粒体损伤)、中期(神经元死亡、细胞凋亡)和症状前晚期(小胶质细胞变化、细胞通讯)。预测模型揭示了一个六蛋白亚群,与传统生物标志物相比,可以更有效地区分 MCs 和 NCs。
Science
中文标题:活动性长冠状病毒肺炎伴有血栓炎症体征的持续性补体失调
影响因子:44.7
发表年份:2024年
合作单位:瑞士苏黎世大学
主要结论:Long Covid 是一种病因不明的衰弱性疾病。研究人员对 COVID-19 患者的血清进行了多模式蛋白质组学分析,对 6500 个纵向样本的蛋白质组学分析显示,补体系统的激活失调,是一种先天免疫保护和稳态机制。因此,活动性 Long Covid 的特征是终末补体系统失调和替代和经典补体途径的持续激活。此外,Long Covid 中溶血、组织损伤、血小板活化和单核细胞-血小板聚集的标志物增加。机器学习证实补体蛋白和血栓炎蛋白是主要生物标志物。
顶刊文章目录
JAMA 3篇
Research
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1. Development and Validation of a Protein-Based Risk Score for Cardiovascular Outcomes Among Patients With Stable Coronary Heart Disease. doi:10.1001/jama.2016.5951 |
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2. Using Aptamer-Based Technology to Probe the Plasma Proteome for Cardiovascular Disease Prediction. doi: 10.1001/jama.2016.6110. |
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3. Evaluation of Large-Scale Proteomics for Prediction of Cardiovascular Events.doi:10.1001/jama.2023.13258 |
Nature 9篇
Research
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1. Human knockouts and phenotypic analysis in a cohort with a high rate of consanguinity. doi:10.1038/nature22034. |
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2. Genomic atlas of the human plasma proteome. doi: 10.1038/s41586-018-0175-2 |
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3. Aging hallmarks exhibit organ-specific temporal signatures. doi:10.1038/s41586-020-2499-y. |
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4. Evaluating microbiome-directed fibre snacks in gnotobiotic mice and humans. doi: 10.1038/s41586-021-03671-4. |
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5. Exercise plasma boosts memory and dampens brain inflammation via clusterin. doi: 10.1038/s41586-021-04183-x. |
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6. An atlas of genetic scores to predict multi-omic traits. doi: 10.1038/s41586-023-05844-9. |
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7. Large-scale plasma proteomics comparisons through genetics and disease associations. doi: 10.1038/s41586-023-06563-x. |
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8. Organ aging signatures in the plasma proteome track health and disease. doi: 10.1038/s41586-023-06802-1. |
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9. Smoking changes adaptive immunity with persistent effects. doi: 10.1038/s41586-023-06968-8. |
Cell 7篇
Research
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1. Growth Differentiation Factor 11 Is a Circulating Factor that Reverses Age-Related Cardiac Hypertrophy. doi: 10.1016/j.cell.2013.04.015. |
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2. Vascular Disease and Thrombosis in SARS-CoV-2-Infected Rhesus Macaques. doi: 10.1016/j.cell.2020.10.005. |
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3. BET inhibition blocks inflammation-induced cardiac dysfunction and SARS-CoV-2 infection. doi: 10.1016/j.cell.2021.03.026. |
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4. Liquid-biopsy proteomics combined with AI identifies cellular drivers of eye aging and disease in vivo. doi: 10.1016/j.cell.2023.09.012. |
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5. Mpox infection protects against re-challenge in rhesus macaques. doi: 10.1016/j.cell.2023.08.023. |
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6. Cancer biomarkers: Emerging trends and clinical implications for personalized treatment. doi: 10.1016/j.cell.2024.02.041. |
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7. CSF proteomics identifies early changes in autosomal dominant Alzheimer’s disease. doi: 10.1016/j.cell.2024.08.049. |
Science 6篇
Research
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1. High-Resolution Molecular Discrimination by RNA. doi: 10.1126/science.7510417. |
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2. Co-regulatory networks of human serum proteins link genetics to disease. doi: 10.1126/science.aaq1327. |
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3. Effects of microbiota-directed foods in gnotobiotic animals and undernourished children. doi: 10.1126/science.aau4732. |
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4. The nucleolus functions as a phase-separated protein quality control compartment. doi: 10.1126/science.aaw9157. |
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5. Mapping the proteo-genomic convergence of human diseases. doi: 10.1126/science.abj1541. |
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6. Persistent complement dysregulation with signs of thromboinflammation in active Long Covid. doi: 10.1126/science.adg7942. |
高深度靶向蛋白质组学SomaScan 7K/11K,以其高通量、高精度、高稳定的独特优势,为科研人员提供了新的强大工具,能够更深入地探索血液样本中复杂而微妙的蛋白质变化,进而为疾病的早期预警、精准诊断及有效治疗提供更为坚实的科学依据。
