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376 人阅读发布时间:2024-09-04 17:02
2024年8月,陕西师范大学食品工程与营养科学学院施琳副研究员团队在食品领域国际知名期刊《International Journal of Biological Macromolecules》(JCR一区,IF = 7.7) 发表了题为“Multi-omics insights into anti-colitis benefits of the synbiotic and postbiotic derived from wheat bran arabinoxylan and Limosilactobacillus reuteri”的研究成果。研究发现无论是在简单培养基发酵体系亦或在2型糖尿病患者失调的肠道菌群环境中,麦麸阿拉伯木聚糖(WBAX)均可增殖具有抗炎活性的罗伊氏乳杆菌WX-94(L. reuteri),并调控该菌的色氨酸代谢通路,促使色氨酸(Trp)向芳香烃受体(AhR,如吲哚类代谢物)转化。此外,使用Trp、WBAX、WBAX及L. reuteri的合生元(WBAX + L. reuteri)及后生元(pasteurized L. reuteri cultured with WBAX)干预DSS诱导的慢性结肠炎小鼠,结果表明后生元改善慢性结肠炎效果显著优于Trp及WBAX,主要通过调控色氨酸代谢、短链脂肪酸代谢、AhR/IL22信号通路和FoxO信号通路。本研究首次对比了WBAX和L. reuteri的合生及后生元对结肠炎症的干预效果,揭示了WBAX衍生益生产品的潜力,为后续WBAX益生功效研究增添新意。中科新生命为该研究提供了16s测序、非靶代谢和靶向色氨酸代谢的检测服务。
图1 WBAX 和 L. reuteri 的体外发酵及其对 DSS的影响
2. WBAX联合L. reuteri干预修复肠屏障损伤
紧密连接蛋白(ZO-1、Occludin、Claudin-1)的免疫组化、RT-qPCR测定、Western Blotting验证表明,经过WBAX联合L. reuteri干预,由DSS诱导的结肠屏障损伤得以修复,其中pasteurized L. reuteri cultured with WBAX的作用更为显著。
图2 WBAX联合L. reuteri干预修复肠屏障损伤
3. WBAX联合L. reuteri有效介导氨基酸代谢、FoxO信号通路和细胞凋亡
转录组分析主要靶向炎症发生(IL-6, IL-10)、氨基酸代谢(Aox2, Abat, Ehhadh)、FoxO信号通路(Tgfb2, Tgfb3)以及细胞凋亡,并通过RT-qPCR及免疫组化分别在mRNA和蛋白水平得以验证。pasteurized L. reuteri cultured with WBAX在IL-6、Acox2、Tgfb2基因表达及细胞凋亡上存在更多优势。
图3 WBAX联合L. reuteri对DSS关键通路和靶点的影响
4. WBAX联合L. reuteri干预有效调控肠道菌群
和NC组相比,DSS干预降低了g_Allobaculum、g_Lactobacillus、g_Akkermansia、g_Muribaculaceae的相对丰度,提高了g_Prevotella、g_Lachnoclostridium、s_Alistipes_inops、g_Odoribacter、s_Ileibacterium_valens的相对丰度。WBAX、WBAX + L. reuteri及pasteurized L. reuteri cultured with WBAX均不同程度的恢复DSS诱导的肠菌异常:WBAX显著提升g_Allobaculum、g_Lactobacillus、g_Akkermansia、g_Oscillibacter、g_Bifidobacterium;WBAX + L. reuteri显著调控g_Parvibacter、g_Klebsiella、g_Muribaculaceae;pasteurized L. reuteri cultured with WBAX显著调控s_Lactobacillus_sakei、g_Faecalibacterium、g_Gastranaerophilales、g_Muribaculum、g_Dialister、g_Desulfovibrio。
图4 WBAX联合L. reuteri对肠道菌群的影响
图5 WBAX联合L. reuteri显著调控粪便代谢组
6. 核心肠道菌、代谢物和结肠炎基础指标的相关性分析
分析结果表明,核心微生物、代谢物和结肠炎基础指标之间存在强关联性,g_Lactobacillus、g_Muribaculum、g_Gastranaerophiles和s_Lactobacillos_sakei与色氨酸代谢产物、SCFA和某些生物活性肽呈密切正相关,这些代谢物被pasteurized L. reuteri cultured with WBAX显著上调,而g_Paraprevotella、g_Oscilloibacter和g_Desulfovibrio则与这些代谢产物呈负相关关系。
图6 菌群、代谢物及DSS基础指标的相关性
7. 人群数据探究及分子对接验证
MicroPhenoDB数据库中的IBD患者相关菌群数据和gutMgene数据库中肠道菌群相关的代谢物和靶点分析表明,本研究中有78个肠道菌属和15种代谢物与人群数据库重合。核心代谢物和IBD关键靶点通过分子对接进行进一步验证,发现结合能均在-4.2至-9.3 kcal/mol之间,其中,吲哚乙酸、部分胆汁酸(12-酮脱氧胆酸、牛磺脱氧胆酸、脱氧胆酸和异脱氧胆酸)和氨基酸(L-同型半胱氨酸)与核心靶点显示出很强的结合能力。
图7 人群数据探究及分子对接验证
8. 后生元抗结肠炎机制探讨
WBAX后生元(pasteurized L. reuteri cultured with WBAX)通过显著调控色氨酸代谢细菌(g_Muribaculum、g_Dubosiella、g_Ruminococcus)的丰度、降低促炎细菌(g_Paraprevotella、g_Desulfovibrio和g_Clostridia)和粘液降解细菌(g_Allobaculum)的丰度、促进色氨酸向吲哚类衍生物的转化、增强AhR和IL-22的结肠表达、上调胆汁酸代谢物(12-酮脱氧胆酸、甘胆酸、脱氧胆酸)和短链脂肪酸(乙酸、bing酸、戊酸)、促产生物活性肽(Lys-Ile-Lys、Ile-Arg、Ser-Met-Lys)和糖脂类代谢物(棕榈酸、脱氧肉碱)、介导氨基酸代谢(Aox2, Abat, Ehhadh)和FoxO信号通路(Tgfb2, Tgfb3)改善肠屏障、抑制炎症发生、缓解结肠炎。
施琳 副研究员
周兰荠,陕西师范大学食品工程与营养科学学院硕士研究生,研究方向为食品营养科学,以第一作者发表SCI论文4篇,中文核心论文2篇。
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