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Science | P7K技术揭秘:长新冠患者补体失调,血栓炎症风险不容小觑

人阅读 发布时间:2024-03-14 16:36

新冠感染者中约有5%不能从疾病中恢复,从而出现长期并发症,称为长新冠。关于造成长新冠的原因假设包括组织损伤、病毒库、自身免疫和持续炎症,但目前仍无明确的诊断标志物和治疗方案。

2024年1月29日,国际顶刊Science(IF 56.9)在线发表了瑞士苏黎世大学医院Onur Boyman团队的创新研究成果“Persistent complement dysregulation with signs of thromboinflammation in active Long Covid”,基于somascan平台的超高深度血清靶向蛋白质组,进行了268个纵向样本的6500多种蛋白质检测,发现经历长新冠的患者补体系统激活失调,并利用机器学习筛选了相关标志物。这项研究不仅有助于我们理解导致长新冠的原因,还为该疾病的诊断和治疗提供了新的依据。



 

研究队列及相关技术

队列:健康人(n=39);新冠患者(n=113),选择其中40名进行长期跟踪纵向研究

技术:somascan,SC RNA-seq等

 

主要发现

1. 随访6个月持续性长新冠肺炎患者的血清蛋白质组分析

在新冠急性感染期和6个月随访期间收集患者和对照组健康人的血清样本进行基于somascan平台(P7k)的靶向蛋白组学分析,检测到6596种蛋白质,并对差异蛋白进行通路富集分析,发现6个月长新冠患者在新冠急性感染期间“补体级联”、“补体级联调控”和“免疫系统”通路显著富集(图1D)。此外,重症急性患者和6个月长新冠患者的富集蛋白存在高度重合(图1E),而补体成分C7在6个月长新冠患者中显著降低(图1F)。然后作者分析了长新冠与C7相关生物学通路的蛋白簇的相关性(图1G),并在独立外部队列中验证了长新冠患者中补体失调的结果。


图1

2. 长新冠患者补体成分C7复合物降低

在6个月随访中,轻症和重症新冠患者的C7复合物持续降低,但与健康对照组无显著差异。6个月长新冠患者C7复合物减少,但期间恢复的长新冠患者的血清水平正常,急性感染期与6个月随访样本无显著性差异(图2B-F)。后发现在6个月的长新冠患者中没有检测到C7特异性自身抗体反应增加,提示自身抗体不干扰C7复合物的形成(图2 G-H)。


图2

 

3. 长新冠患者C5bC6及补体活性增加

长新冠患者在急性感染期和6个月随访时的C5bC6均高于非长新冠和随访前恢复的患者,在急性期最高,并随时间持续升高。sC5b-9复合物浓度随着急性新冠严重程度增加,在6个月的随访中无差异。急性感染期和长新冠患者的补体活性增加,但在恢复的患者中并无该症状。此外,研究对象的补体活性与TCC组分和C5bC6/C7复合物的比值相关(图3)。


图3
 

4. 经典和旁路补体激活与长新冠相关

长新冠患者在急性感染期和6个月随访时,C2增加,而血清中的抗凝血酶Ⅲ持续低水平(图4B、G);B因子在急性感染期升高;补体C3d在6个月的随访中也较健康对照组升高(图4D、F)。为了进一步验证补体系统失调,对新冠患者6个月随访时的血清样本进行了质谱分析,发现6个月长新冠患者与未感染长新冠的患者相比,差异显著的蛋白主要涉及补体成分(图4I-O )。

 
 


图4


5. 补体介导组织损伤

结合somascan和质谱蛋白组学分析,作者评估了49种不同的血清生物标志物,最终确定了8个和6个月长新冠相关的测量值,包括血液结合素、ICAM-1和S100-A8/A9的降低, TSP-1和vWF的增加(图5)。


图5


6. 单核细胞-血小板聚集体增多

在细胞水平上探究血栓炎症的特征,发现单核细胞表面CD41的表达和长新冠患者有关(图6H 、I)。后又对单核细胞进行单细胞转录组学分析(图6J ),没有发现其促血栓形成的转录特征(图6K ),但证实了它们缺乏CD41 mRNA的表达。此外,还发现IL1B和NR4A1低表达,IFITM3高表达(图6K)。

 

图6
 

7. 经典补体激活与抗疱疹病毒IgG相关

为了鉴定6个月长新冠中可能驱动经典补体激活的抗体,作者研究了自身抗体和抗病毒抗体,发现抗CXCL13低水平与6个月长新冠显著相关。此外,还有高抗巨细胞病毒、高抗CMV和抗EBV 的IgG也与6个月长新冠相关 (图7)。


图7

 

8. 血清蛋白质组学用于长新冠的诊断和预测

通过机器学习算法筛选长新冠的生物标志物。根据新冠急性期严重程度对相关数据进行分层量化,后又确定年龄、C5bC6/C7复合物比率、vWF/ADAMTS13比率和患者体重指数( BMI )作为驱动变量,在受试者队列中预测12个月长新冠(图8)。


图8

 

 总结

该研究采用基于somascan平台的血浆蛋白质组(P7k)分析揭示了经历长期新冠的患者补体系统激活失调,并利用机器学习发现相关诊断标志物。该技术可有效检测超高深度的血液蛋白(现可靶向检测11000种血液蛋白),不仅突破过往血液蛋白质检测低覆盖度的技术壁垒,而且还具备高稳定性、高准确性的特点,为具有转化潜力的标志物的发现提供了坚实的技术保障,使我们可通过血液样本挖掘更多疾病相关的机制机理。

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