当质谱技术与蛋白质组学碰到了一起，则会产生出强烈的化学反应！十几年的时间，蛋白质组学的研究对象从细胞模型、动物模型，到人的体液、组织等人体样本，应用范围的生物复杂度越来越高。研究目的，也从最初的肽段序列推导，到多肽和蛋白质的定性定量分析，翻译后修饰，再到如今成为新热点的空间层面蛋白质信息挖掘，总之，势不可挡！
 

图1 蛋白质组学研究流程

图2 DDA和DIA基本原理和性能比较

中科新生命自2016年开始提供商业化的DIA定量蛋白质组学服务至今，已形成了从高通量检测到分析的完整技术平台，开发了特色激酶分析及与其他组学的联合分析方案，已助力客户发表了几十篇高分文章。接下来，请跟随小编一起看一看近几年的高分客户文章都利用DIA定量蛋白质组做了哪些研究吧！


 

1、致病靶点研究—原发性胆管炎的致病靶点

影响因子：16.6

合作单位：第三军医大学第一附属医院

本研究通过多种方法联合鉴定出肝脏中独特的DUOX2⁺ACE2⁺小胆管细胞，并验证了其减少与PBC疾病严重程度的相关性。此外通过4D DIA蛋白质组定量分析证实了pIgR在DUOX2⁺ACE2⁺小胆管细胞中的高表达。主要结果：

① PBC肝脏单细胞转录组图谱；

② 在人类和小鼠肝脏中发现独特的高表达的DUOX2⁺ACE2⁺小胆管细胞；

③ DUOX2⁺ACE2⁺小胆管细胞数量显著减少与胆汁分泌障碍和PBC严重程度密切相关；

④ PBC发病过程中，免疫应答与肝脏DUOX2⁺ACE2⁺小胆管细胞数量的选择性减少有关，也可能通过细胞-细胞相互作用影响其他类型的胆管细胞；

⑤ pIgR特异性自身抗体可能与DUOX2⁺ACE2⁺小胆管细胞损伤有关。

 

2、机制研究—mRNA m⁶A修饰的读写参与小鼠从母体到合子的转换过程

影响因子：12.3

合作单位：中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心、上海交通大学医学院公共卫生学院

本研究旨在揭示小鼠MZT过程中的m⁶A修饰的动态变化，鉴定了少量参与着床前胚胎发育的m⁶A调控分子，初步阐明了Ythdc1可能参与母源继承m⁶A转录本的稳定性调控。主要结果：

① MZT期间m⁶A标记mRNA的动态图谱分析；

② m⁶A修饰功能分析：促进RNA衰变，亦可维持RNA稳定；

③ m⁶A修饰通过维持mRNA的稳定性调控MZT；

④ Ythdc1结合m⁶A修饰的mRNA并调控其稳定性。

 

3、筛选生物标志物—蛋白质组学揭示I期和II期宫颈癌中不同的肿瘤微环境

影响因子：11.3

合作单位：佛山市第一人民医院

本研究研究利用snRNA-seq及DIA蛋白质组学分析比较了I期和II期CC患者TME内的细胞异质性和功能，II期CC患者几乎所有免疫细胞的异质性都在很大程度上被调节，其表型明显具有免疫抑制作用。还发现了胶原蛋白的显著上调，可能被用作预后标志物。主要结果：

① 鉴定I期和II期宫颈癌的肿瘤细胞组成；

② CCI组与CCII组间的细胞组成差异及细胞群差异表达分析；

③ CCI和CCII组稍微DIA定量蛋白质组学显示CCII患者存在明显的免疫抑制。

 

 

小结

以上只是几篇中科新生命DIA定量蛋白质组客户文献的简单分享文章，DIA定量蛋白质组技术的具有多种应用场景，具体为：

药物应答、基因敲除/过表达的蛋白表达谱分析

植物、微生物生长发育与胁迫逆境生理研究

疾病生物标志物与药物作用靶点高通量分析

蛋白作用机制与特殊功能蛋白质筛选各种物种的蛋白质组草图构建

如果老师需要更多项目文章，欢迎联系我们。我们将提供更好的产品和更优质的服务，助力您的科研事业！

 

 

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