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788 人阅读发布时间:2019-04-18 13:49
Nature 旗下的 Molecular Psychiatry(IF=11.64)是精神疾病领域的 top 期刊。

在 19 年 1 月发表了一篇题为「Complement pathwaychanges at age 12 are associated with psychotic experiences at age 18 in alongitudinal population-based study: evidence for a role of stress」的文章,文中利用了 DIA 技术,研究补体系统与精神异常的关系。

Complement pathway changes at age 12 are associated with psychotic experiences at age 18 in a longitudinal population-based study: evidence for a role of stress
IF=11.64
补体级联是免疫系统的重要组成。越来越多的证据表明,补体系统异常与精神疾病有密切关系。为了进一步证明两者之间的关系,研究者对来自于 UK avon longitudinal study of parents and children(ALSPAC)队列中的血液样本,进行了 DIA 蛋白质组检测,重点关注其中 29 个补体级联相关蛋白的表达水平。结果显示,6 个蛋白的表达水平与精神异常相关。利用大鼠慢性应激模型,该研究结果进一步表明:慢性应激可能引起补体通路异常,与精神异常有显著相关性。(小编:如果进一步研究一下他们的肠道菌群,可能会有更多的发现)
对于为什么采用 DIA 技术进行血浆蛋白质组研究,作者在文中给出了说明:DIA 技术避免了非靶向蛋白质组学研究中会遇到的许多问题,比如缺失性,原文如下:

作者对于文章中图表和结果的展示采取的是「less is more」原则,2 table+1 figure,Results 全文也仅有 3 段话:

1 个 table 和 1 个 figure:列出所检测的几个补体通路相关的表达水平。

虽然话少,但作者为保证数据的严谨性,特意在进行数据分析时,剔除了两个样本的信息,原因是因为该样本的色谱信息不好,原文如下:

跟本平台一样,对 DIA 的数据有着严格的质控,色谱的评价是非常重要的,但是却被大家所忽视(中科新生命的 DIA 数据从 3 个维度评价色谱表现,并将数据呈现在报告中)。
虽然 DIA 是个比较新的技术,但凭借着覆盖度、重现性、准确度方面的革新式提升,DIA 已经出现在越来越多的高水平研究中。随着 2019 年的到来,我们一定会看到越来越多 DIA 技术的应用被报道。
中科新生命不仅是在国内最早推出 DIA 服务的平台,而且也是仅有的对 DIA 进行持续深度开发的平台。例如,针对临床最高频研究样本——血浆,我们实现了单个样本、无需去除高丰度蛋白、无需分级、2 h 时长定量 1000+蛋白的分析能力,该突破被大 V 平台广泛关注和报道(例如 Bioart 之前的一篇推文:蛋白质组学技术新突破:血液样本 DIA,定量蛋白数创新高)。后续,同样的技术升级我们也将移植到其他类型样本上,敬请期待。
最后再给要发 DIA 文章的老师们加一把力:

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注:上述数据为 MedSci 实时信息,动态变化,仅用于科学研究,不得作任何商业用途。