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一文了解植物脂质组的特色和应用
人阅读 发布时间:2023-03-15 15:00
图1 代表性脂质结构(A) 脂肪酸和甘油磷脂(B) 甘油脂(C) 鞘脂(D) 固醇脂(E) 聚酮、糖脂和孕烯醇酮脂。
表1 主要植物脂质类别及其功能
参考文献:DOI:10.1039/d1mo00196e
植物脂质组
产品定义
利用基于LC-MS/MS的非靶向脂质组学方法,对植物样本中的脂质进行大规模的定性定量分析,包含在植物中广泛存在的甘油糖脂类物质,并可以通过添加脂质亚类内标实现绝对定量,揭示生物机体中生理病理过程中的脂质变化。
技术优势
专业脂质数据库LipidSearch:170万种脂质分子谱图库,其中包含植物中广泛存在的甘油糖脂类化合物。目前使用的版本具有处理大型/复杂数据集的速度更快,注释和定量更准,涵盖脂类子类更广等优势;
高定性能力:平均鉴定数量2500+。
LipidSearch脂质数据库物质类别
数据分析
部分数据分析结果展示:
项目经验
植物脂质组产品目前已积攒丰富的项目经验,做过的项目涉及经济作物如小麦、玉米、水稻、木薯、枇杷、杏、石榴、油茶,中药材如铁皮石斛、丹参、杜仲、生姜,模式生物拟南芥等物种,样本类型除常见的根、茎、叶、花、种子外,也包含粗油提取物、囊泡、乳胶、蜡质等,下面展示部分实测项目经验。
项目案例分享
#1
文献名称:SWOLLEN TAPETUM AND STERILITY 1 Is Required for Tapetum Degeneration and Pollen Wall Formation in Rice
水稻SWOLLEN TAPETUM AND STERILITY 1 (STS1)是绒毡层退化和花粉壁形成所必需的
发表期刊:Plant Physiology
影响因子:8.005
发表时间:2022
合作单位:四川农业大学
研究内容:研究发现 SWOLLEN TAPETUM AND STERILITY 1 (STS1) 基因的突变会导致水稻绒毡层降解延迟和花粉壁形成中止,并结合植物脂质组学和转录组学等技术证实了STS1 是生殖发育中脂质生物合成的重要因子,参与花药脂质稳态。该研究为植物雄性生殖发育及花药脂质代谢的调控机制提供了新的见解。
#2
文献名称:A very-long-chain fatty acids synthesis gene, SD38, influences plant height by activating ethylene biosynthesis in rice
超长链脂肪酸合成基因SD38通过激活水稻C₂H₄生物合成来影响株高
发表期刊:Plant Journal
影响因子:7.091
发表时间:2022
合作单位:西南大学
研究内容:本研究鉴定到一个水稻半矮秆突变体sd38,其细胞长度显著变短 ,SD38编码参与超长链脂肪酸(VLCFAs)合成的β-酮脂酰-CoA合酶(KCS)。表达分析表明,SD38定位于内质网(ER)膜上,并以不同的丰度在所有分析组织中表达。植物脂质组学分析发现SD38的突变影响了sd38突变体的脂质代谢。通过酿酒酵母的异源表达实验和外源脂肪酸诱导实验揭示了VLCFAs、C₂H₄生物合成和株高之间的关系,有助于提高对作物株高发育的理解。
#3
文献名称:Silencing of Sulfoquinovosyl Diacylglycerol Synthase 1 Impairs the Glycolipids Accumulation and Photosynthesis in Phosphate-deprived Rice
OsSQD1的沉默损害缺磷水稻的糖脂积累和光合作用
发表期刊:Journal of Experimental Botany
影响因子:7.298
发表时间:2021
合作单位:上海市农业科学院
研究内容:文章主要使用植物脂质组学研究了OsSQD1突变体中不同的脂质种类和脂肪酸浓度,阐明了OsSQD1沉默导致Pi缺乏下磷脂的增加和糖脂的减少。此外,OsSQD1沉默还通过下调水稻芽中的糖脂抑制光合作用。本研究结果表明,OsSQD1在糖脂积累中起关键作用,这是影响光合作用对Pi缺乏反应的一个原因。