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995 人阅读发布时间:2018-07-24 10:24
中科新生命,成立于 2004 年,专注于质谱技术方法在科技服务、生物医药、精准医疗领域的应用开发。12 年质谱服务经验,每年处理样本数超万例,通过与中科院的技术合作及企业研发团队的自主创新,致力成为您最具价值的生物技术合作伙伴。
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四步搞定四分文章
蛋白质组学技术大家应该都有所了解。今天,小编就结合一篇文章来说说蛋白质组学文章套路的问题,来来来,不浪费时间了,先上车(老司机带路):

上面就是目前纯蛋白质组学文章发表的框架,下面就结合一篇最新的组学文章详细聊聊:
Journal of Proteomics IF=3.9140(2017.09)
Thyroid-associated orbitopathy and tears: A proteomics study
第一步:材料收集
表型差异材料:28 例 TAO 病人和 25 例健康人的眼泪样品(病人和健康人各自混样)
第二步:组学定量分析
实验技术:2 次独立的 TMT 六标实验
实验结果:两次分别定量到 646 和 442 个蛋白质组,汇总后一共检测到 712 个蛋白质组,其中 376 个蛋白质组两次都检测到。作者列出变化最明显的蛋白信息:

第三步:靶向蛋白验证
蛋白选择与验证方法:作者选择了三个蛋白后期进行靶向验证,Cystatin C(western blot),alpha-1 antichymotrypsin(ELISA)和 retinal dehydrogenase 1(ELISA);从蛋白选择也暴露了作者的小心机。
尤其注意,靶向验证阶段作者是一例例的进行检测的!!!



第四步:机制解析
最后,对这三个靶向验证的蛋白功能进行一系列的讨论分析,对文章的创新点进行一系列的总结。
…… 吧啦吧啦吧啦,你懂得!
蛋白质组学技术的广泛认可使得文章发表越加的有迹可循,上面的分析是不是给大家一个很清晰的套路了呢,嘿嘿。
另外,可能还有老师有个问题,
万一我前期做了蛋白组,
找到了想靶向验证的蛋白,
可是,
买不到抗体怎么办!!
等等!
别拦我,我要发大招了
针对没有抗体的蛋白靶向验证我们也有新的解决方案:Parallel Reaction Monitoring(PRM, 平行反应监测)
先来围观一下 2012 年发表在蛋白质组学领域的顶级期刊 MCP 上的这篇文献报道。

该文章对 PRM 技术进行了详细深入的报告和介绍。PRM 结合了四级杆的高选择性及 Orbitrap 高分辨率的特点,能够对二级质谱进行独立的定性定量研究,方法流程更加简化之外,还具有优秀的抗背景噪音干扰能力。与 WB 实验相比,PRM 还具有优秀的排除非特异结合蛋白干扰的能力。
关于中科新生命:
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